Παρ' όλες τις ευεργετικές τους ιδιότητες, η χρήση τους απαιτεί σύνεση και προσοχή αφού είναι ουσίες υψηλής συγκέντρωσης, πτητικές και πολύ διεισδυτικές που μπορούν να γίνουν βλαβερές σε ελεύθερη χρήση τους.
Τα αιθέρια έλαια δε θα πρέπει να χρησιμοποιούνται χωρίς τη συμβουλή επαγγελματία αρωματοθεραπευτή, φαρμακοποιού, ή ιατρού. Ειδικότερα στις παρακάτω περιπτώσεις:
- Κατά τη διάρκεια της εγκυμοσύνης και της γαλουχίας
- Σε άτομα τα οποία πάσχουν από σοβαρά προβλήματα υγείας
- Σε βρέφη και παιδιά κάτω των 12 ετών
- Σε περίπτωση αλλεργίας στα αιθέρια έλαια